В фильме Гарри Поттер и узник Азкабана начинается с того, что главный герой втайне от опекунов использует магию и сбегает из дома, случайно надув свою тетю. Он проводит остаток лета в гостинице «Дырявый котел», где узнает от министра магии, что из тюрьмы волшебников Азкабан сбежал опасный преступник Сириус Блэк, который якобы предал родителей Гарри и теперь охотится за ним.
По пути в Хогвартс поезд останавливается из-за дементоров — мрачных стражей, охраняющих Азкабан. Гарри теряет сознание от их присутствия, но его спасает новый профессор защиты от темных искусств Ремус Люпин, который отгоняет существо заклинанием. В школе Гарри, Рон и Гермиона узнают, что Сириус Блэк сумел сбежать, и все считают, что он хочет убить Гарри, чтобы завершить дело Волан-де-Морта.
Гарри получает в подарок от Рона новую метлу «Молния», а Гермиона приобретает пушистого кота Живоглота, который постоянно нападает на крысу Рона Коросту. В процессе обучения профессор Люпин учит Гарри заклинанию Патронуса для защиты от дементоров. Гарри тайком использует карту Мародеров, полученную от Фреда и Джорджа Уизли, чтобы бродить по Хогвартсу под плащом-невидимкой.
В конце года Гарри узнает шокирующую правду: Сириус Блэк невиновен. Настоящий предатель — Питер Петтигрю, который скрывался все эти годы под видом крысы Коросты. Блэк оказывается крестным отцом Гарри. Герои пытаются сбежать на гиппогрифе Клювокрыле, но Петтигрю сбегает. Гарри и Гермиона используют маховик времени, чтобы перенестись в прошлое и спасти Сириуса и Клювокрыла от казни. В финале Сириус улетает на гиппогрифе, а Гарри получает обещание, что сможет жить с ним, когда тот будет оправдан.
